小果教你快速优雅使用Genecards数据库

拜天雨

各位小伙伴大家好，小果和大家又见面了，前面呢小果有分享果关于TCGA数据下载、转录因子的一些数据库，但是都是仅仅提到了一些，今天呢小果来和大家聊一聊Genecard数据库。小果下面的内容从以下方面展开：一是Genecard数据库简介，二是简单使用Genecard数据库。
一、Genecards数据库简介
GeneCards是一个可搜索的集成人类基因组数据库，提供有关所有注释和预测的人类基因的全面、用户友好的信息。该知识库会自动集成来自约150个网络来源的以基因为中心的数据，包括基因组、转录组学、蛋白质组学、遗传、临床和功能信息。该数据库的网站是：https://www.genecards.org。首页是这样的：


二、简单使用Genecard数据库。

• 在这里小果以tp35基因进行数据集的查询，首先我们进入到Genecard数据库的首页，在Search GeneCards中输入tp53基因名，也就是小果在下图中红色标出tp53基因的地方，然后点击放大镜进行搜索，达到数据查询的目的。
  

2. 点击查询后的结果如下图，genecard数据库的查询的结果所有的都显示到了一个页面上，总体来说对用户比较友好，小伙伴可以在Jump to section与Research Product上找到自己所查询基因对应的结果条目，Jump to section有18个小条目，Research Product有13个。


3. 比如说小伙伴们需要查询该基因的基因别名，那么小伙伴可以点击Jump to section下的Aliases就会直接跳转到相应的界面，通过下面的图片可以看出tp53基因的别名有P53，LSF1等，此外还会列举出其他数据中的id信息。


4. 小果这里呢主要是查看下该基因的信号通路有哪些，这时只需要点击下Jump to section中的Pathways就会自动跳转到通路页面，此时只需要要找到小果想要查询信号通路就好了，结果如下，可以看到结果显示有六个信号通路，点击感兴趣的条目就可以查看详细信息了。


到这里呢，小果的分享就到此结束了，小伙伴有什么问题可以私信小果，小果定会及时回复的，期待与小伙伴再会哦。
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